1.房屋租赁登记备案缴纳费用主要有房屋租赁手续费和租赁土地收益金两项，由出租人缴纳。以划拨方式取得土地使用权的房屋进行出租，应按规定予以缴纳土地收益金。
2.房屋租赁手续费，按房屋租赁行为发生的起数，在办理租赁备案登记手续时予以收取。房屋租赁手续费缴纳标准：
一、住宅
1、建筑面积30平方米以下，50元。
2、建筑面积30平方米以上，80元。
3、房屋中有几间房分别出租的，应分别计算。
二、非住宅
1、1000平方米以下，含1000平方米的，200元。
2、1000平方米以上的，300元。
3.法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》第五十三条 房屋租赁，是指房屋所有权人作为出租人将其房屋出租给承租人使用，由承租人向出租人支付租金的行为。
第五十四条 房屋租赁，出租人和承租人应当签订书面租赁合同，约定租赁期限、租赁用途、租赁价格、修缮责任等条款，以及双方的其他权利和义务，并向房产管理部门登记备案。