1、类型不同

工学硕士是属于学术型的硕士，只要是有本科学历就可以报考，工程硕士是属于技术型硕士，必须有3年及以上的工作经历才可以报考，课程学时很少，但是可以有5年时间来完成论文，一般是在职的。

2、学费不同

工学硕士学费有公费和自费，即使是自费个人拿的也少，一般是7500/学年左右，工程硕士学费完全自费，学费较贵。

3、培养特色不同

从培养特色上，一是工程硕士侧重动手、实践技能，而工学硕士侧重学术性、研究能力。

4、教育体系不同

工程硕士与工学硕士两者属于不同的教育体系，工程硕士教育侧重于工程素质培养和工程实践能力训练，工学硕士侧重于基础理论学习和学术研究。