1、指代不同。惟妙惟肖：形容描写或模仿得非常逼真。栩栩如生：形容画作、雕塑中的艺术形象等生动逼真。

2、侧重表达不同。惟妙惟肖：形容描写或模仿得非常逼真，生动形象（不能指动物）。栩栩如生形容画作、雕塑中的艺术形象等生动逼真，就像活的一样。

3、出处不同。

（1）惟妙惟肖：出自蒲松龄的《聊斋志异·各本序跋题辞〈读聊斋杂说〉》：“形容惟妙惟肖，仿佛《水经注》造语。”

白话文：“惟妙惟肖逼真形象，仿佛《水经注》诗句。”

（2）栩栩如生：出自《庄子·齐物论》：“昔者庄周梦为蝴蝶，栩栩然蝴蝶也，自喻适志与！不知周也。俄然觉，则茫茫然周也。”

白话文：“过去庄周梦见自己变成一只美丽的蝴蝶，比真的蝴蝶还美，活灵活现，在空中翩翩起舞。他自觉得非常快活得意，简直忘记了世界还有庄周这么一个人。”