1、化学药物法使用硫酸铜、草甘膦等化学制剂杀灭青苔危险较大，尤其是高温季节硫酸铜毒性加大。采用化学方法虽见效快，但毒副作用最大。

2、物理遮光法根据青苔喜光的特性，可以使用草木灰和麦麸皮进行遮光防治。但由于草木灰容易受风的影响且吸水后不沉淀，使用效果不理想，所以多采用麦麸皮。用物理法的特点就是不要全池泼洒，使用方便，但是麦麸皮腐败以后也会增加池塘的耗氧量。

3、生态防治法定期使用反硝化菌、芽胞杆菌等有益的微生态制剂也有很好的效果。使用生态法见效慢，靠预防为主，但效果稳定，对水生动物生长无任何影响。