1、两者的生物种属不同：帝王蟹归属于属于十足目歪尾亚目石蟹科，比较常见的是堪察加拟石蟹，其并非属于真正的螃蟹；而长脚蟹属于十足目短尾亚目扇蟹科，又叫阿拉斯加皇帝蟹。

2、分布地区不同：帝王蟹主要分布于白令海峡与阿拉斯加东南海域的寒冷深海中；而长脚蟹主要来自北美太平洋北部等寒冷海域、白令海及日本海的深海。

3、形态特征不同：帝王蟹只有三对足外加一对蟹钳，并且其足全部向后弯曲；长脚蟹外形类似于蜘蛛，体重体重可达十磅左右。