1.直接起诉至国土资源部。农民可通过举报的方式，直接举报给国土资源部、中纪委监察部等有关部门，来阻止地方政府的违法征地拆迁。然后，注意收集有效的违法占地的证据，国土资源部在法定的规定的时间内，没有对违法占地进行依法处理，那农民可以直接起诉国土资源部，状告国土资源部不作为。将地方政府违法占地的决定推翻，以此，来维护自己的合法权益。这是一个比较好方法。政府 强制征地的可以去法院起诉。
2.法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第八十二条 擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，或者违反本法规定，将集体经营性建设用地通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得，并处罚款。