可以。南京纳税人办理年度汇算补税的，税务机关提供了多种便捷渠道，纳税人可以通过网上银行、办税服务厅POS机刷卡、银行柜台、非银行支付（即第三方支付）等方式缴纳应补税款。

　　>>>拓展阅读：需要办理年度汇算的情形

　　符合下列情形之一的，纳税人需办理年度汇算：

　　（一）已预缴税额大于年度汇算应纳税额且申请退税的；

　　（二）纳税年度内取得的综合所得收入超过12万元且需要补税金额超过400元的。

　　因适用所得项目错误或者扣缴义务人未依法履行扣缴义务，造成纳税年度内少申报或者未申报综合所得的，纳税人应当依法据实办理年度汇算。