1、吴用原本是山东济州郓城县东溪村私塾先生，自幼结识了晁盖。得到了刘唐的报信，就说服了三阮，应了七星聚会，协助晁盖等人智取了梁中书给太师蔡京献寿的十万贯生辰纲，为躲避官府追缉而上梁山泊。到梁山以后，他智激林冲火并王伦，扶持晁盖作头领，开始了自己的“军师”的生涯 。

2、宋江因题反诗被判死刑时，他让戴宗传假信，不成后参与了谋划劫法场，救出宋江后来投奔梁山。宋江入伙后，又扶持宋江，使宋江坐稳梁山二把手地位，并逐渐架空晁盖的权力 。

3、梁山三打祝家庄时曾多次失败，吴用双掌连环计，让孙立等人深入祝家庄，里应外合攻破庄院。呼延灼用连环马攻打梁山时，又派时迁等人计诱徐宁上山，打败呼延灼。宋江闹华州时，他又出计用宿太尉金铃吊挂，救出了史进和鲁智深。

4、晁盖征曾头市被毒箭射中身亡后，帮助宋江成为山寨之主，改聚义厅为忠义堂。后扮算卦道人，计诱卢俊义上山，同时散布卢俊义已经投降梁山的虚假消息，卢俊义被抓后，攻打大名府。期间又收服关胜。最后，吴用在元宵节令时迁等进入大名府放火，攻取大名府，收服卢俊义。

5、吴用与宋江合梁山兵马攻打曾头市，收服郁保四，用反间计诱史文恭偷袭，攻破曾头市。大聚义排列位次时，坐第三把交椅，任梁山掌管机密军师。后多次协助宋江争取招安时机，也指挥了战胜高俅、童贯的战役。

6、梁山起义军受朝廷招安后，吴用又佐宋江、卢俊义征伐辽国、田虎、王庆和方腊等，被朝廷封为武胜军承宣使。后因宋江被害，深感朝廷奸佞当道，恐刑戮及身，并忠于宋江，与花荣一同自缢于楚州南门外蓼儿洼宋江墓前，尸身葬于宋江墓侧。