1、选种换种。作种用的马蹄应在春节前挖收，选择外形扁圆、端正，表皮光滑，皮色红褐一致，芽头粗壮，单果重16-18克的球径作种荠。马蹄种植2-3年后，种性退化，抗病力下降，应进行异地换种。

2、育苗移栽。马蹄的秆枯病主要是种荠带菌引起，种荠消毒可用50%多菌灵600倍液+70%甲基托布津800倍液，或12.5%敌力康1500-2000倍液浸泡18-20小时，然后排种育苗。

3、加强肥水管理：【施足基肥】早稻收割后犁耙稻田，清除杂草，亩施腐熟农家肥。