在海水水族箱的清洗时，它的过程与上面水族箱的清洗过程基本一致，一些需要注意的地方将特别指明。

①打开照明系统，检查水族箱内的生物及设施的运转是否一切正常，检查水族箱内部的浑浊度及箱体的肮脏情况。

②关闭电源，移走观赏鱼及其他生物。

③拆除相关设施，主要有拆除照明设施、增氧设施及过滤设施等并贮存海水。

④清洗过滤系统，这是清洗的重点，要一步一步地进行，而且要做到所有的部件都要清洗，主要有生化棉、过滤棉、生化球、水泵等。

⑤清洗底砂及珊瑚砂等。

⑥清洗水族箱体。

⑦吸去脏水。利用虹吸管抽取沉淀在珊瑚砂上的脏物和浮于水中的杂物。

⑧擦拭箱体．检查是否干净。

⑨铺好底砂，底部过滤设施此时要埋好过滤管道。

⑩进水。所有设备安装好后，将提前密封处理过的天然海水或人工调配的海水．用非金属容器盛装并徐徐注入水族箱中，待水流循环一段时间后，继续测量调整，直至比重达到1.022的标准为止。