养鱼常用的肥料有有机肥料和无机肥料两大类。有机肥料包括粪肥、厩肥、堆肥和绿肥。粪肥包括人粪尿、畜粪和禽粪。人粪尿的特点是含氮量高，肥效较畜粪快，但直接施用对水质影响较大。家畜粪里有较多的有机物，磷、氨的含量没有人粪尿高，消化的程度也没有人粪尿完全，因而腐熟较人粪尿困难一些。其中牛是反刍动物，咀嚼细致，又经过复胃的作用，粪质细密，含水量高，空气不流通，所以腐热困难，有冷肥之称，马咀嚼粗糙，粪含纤维素多，水分少，疏松多孔，容易腐熟，腐熟过程中温度显著升高，所以称为热肥。禽粪含较多的磷质，养鱼效果也很好。

厩肥是家畜的粪尿和垫圈的土草等混合物经过长期堆积腐熟而成。厩肥在鱼池使用不可掺入过多的泥土，以免池塘填浅。

堆肥是用各种废弃的植物残体如秸秆、杂草，落叶等堆积起来腐熟而成。

作肥料的鲜嫩植物称为绿肥。广西僮族自治区的渔民很早就用绿肥养鱼，并积累了丰富的经验。他们常用的绿肥是艾蒿一类的植物，称为大草。这类植物有强烈的香味，枝叶肥厚，易于腐熟，腐熟后剩余的纤维素不多，是比较好的绿肥。但选采绿肥不要过于讲究，除有毒者外，一般植物都可用于沤绿肥。只不过腐熟时间比大草慢一些。例如，东北地区种土豆较多，在土豆收获之际，正是夏初鱼池施肥的大好时节，正好用土豆蔓作绿肥。

鱼池施用的无机肥料，主要是含氮和含磷的化肥，很少使用钾肥。

含氮的化肥有硫酸铵、碳酸氢铵、尿素，氨水、硝酸钠、硝酸铵等。尿素虽然是化肥，但与其他化肥不同，它是有机态氮肥。不过，尿素的分子很简单，与其他无机化肥一样，作用也很迅速。

常用的磷肥是过磷酸钙，过磷酸钙与许多氮化肥不同，施入水中后易被池底淤泥吸附，使水中含磷量很低。被吸附的磷肥在以后的时间内，可以慢慢被释放，所以过磷酸钙是一种肥效很长的化肥。